第一方治夏秋暑湿时疟初起。平胃除湿，理气化滞，有疏导开先之功。受病轻者，一二剂即愈。
制半夏 广橘皮 云茯苓 威灵仙各一钱茅苍术 紫厚朴 柴胡 黄芩各八分青橘皮 广摈榔各六分 炙甘草三分 生姜一钱
河井水各一盏煎，空腹温服，如头痛加白芷八分。按此方合小柴胡、平胃散，青皮饮三方为一，面以槟榔易草果之辛烈，加威灵仙，通行十二经络，彻内外而透邪出表，故奏效捷而成功伟也。盖人身中水湿有形之阴邪，每留着于肠胃，多化为热；中暑热无形之阳邪，每游溢于经络与湿相搏，遂化为疟痢。暑邪初中，不为湿所羁留，而即病自当从暑治，香薷散等方，表散之而外出是也，既化为疟痢，则当从疟痢治，犹米已成饭，不可以出汁，须由里而和之，使外出是也。故治疟发表非治法也，尽用麻，桂、羌、防，几曾见一汗而愈者?疟邪之汗，犹之瘟疫同法，必里气和而表自解。倪先生此方，专以疏利留着之湿邪为主，而以和胃化滞为佐。独黄芩一味，堪清游溢经络之暑热，可与疫症达原饮同调，不藉香茹之发表，而况麻、桂、羌、防，散太阳风寒之晶，可浪施乎?至若但热不寒之瘅疟疫厉，传变之温疟，自有白虎、承气在，但寒不热之牝疟，则又有附子理中、大小建中在，亦非徒恃发表可愈也。
第二方 治疟发三四次后，痰滞稍减，正气渐亏，一二剂即可止住。即极弱之人，缠极重之症，十剂后无不奏效。
生何首乌三钱 醋炙鳖甲?知母各二钱白术 当归 威灵仙各椙? 白茯苓 黄芩柴胡 广橘皮各八分 炙甘草三分 生姜一钱
河井水各半。煎，加无灰酒一盏，再煎数沸，空心温服。按此方妙在补泻互用，虚实得宜，不用人参、黄耆之骤补，屏去常山、草果之峻削，平平无奇，却神有效。慎勿混行加减，即无效矣。盖疟舍于营，邪伤血分，表邪稍解，当顾营血。方中首乌、鳖甲、当归正力血分药也。
第三方 治久疟虚弱并虚人患疟，扶正祛邪大有神效。
人参(或以玉竹代之，沙参无益也) 炙黄耆各一二钱 白术钱半 当归一饯?柴胡橘皮各八分 升麻四分 炙甘草三分 生何首乌二钱 大枣一枚 生姜八分
渴加知母一钱，热甚加青蒿八分，胃口不和加麦芽一钱，在半饥时服。
《素问》疟论，黄帝问曰；痃疟皆生于风，其蓄作有时者，何气使然?岐伯对曰：阴阳上下交争，虚实更作，阳并于阴，则阴实而阳虚。阴胜寒生于内，阳虚寒生于外，故中外皆寒极，则阳回而外出。阴并于阳，则阳实而阴虚，阳盛则外热，阴虚则内热，内外皆热，故喘而渴，欲饮冷也，此皆得之。夏伤于暑，热气盛，藏于肌肉之内，肠胃之外，此营气之所舍也。令人汗孔疏，腠理开。因得秋气，汗出遇风，及得之浴，水气舍于皮肤之内，与卫气并居。卫气者，昼日行于阳，夜行于阴。此气得阳而外出，得阴而内薄，内外相薄，是以日作其间。日作者，由邪气内薄于五脏，横连于募原，其道远，其气深，其行迟，故间日发也。至间数日发者，邪客于六腑有时，与卫气相失，故数日乃作也。
按经文则疟为先伤暑湿，后感寒风，构煽而起，其病根于肌肉之内，营气界分。不比风寒，骤感之在皮毛，不与营气相涉，可用麻、桂，羌，防发表，一汗而愈也。故治法必求之营气，用药必遵夫和解，由半表半里之间，导之使出。半表半里者，少阳之分也。少阳为枢，开阖必经之地也。虽刺疟篇有三阴三阳五脏及胃腑十二疟形状，乃邪走空窍，游溢于虚隙之处而现症，究其受病之原，乃舍于营分及募原皆半表里也。惟间数日者，则舍于六腑而更深入。然求其外出，亦必由少阳之枢辟，而后甫能达之皮毛。故小柴胡为治疟要药，奈今人因李士材有疟非少阳者，慎用柴胡一语，寒邪在太阳者，柴胡投早引入少阳等语，举世畏柴胡如虎，而治疟有终始弃置不用者。讵不思非少阳者，固不可用，在少阳者，非此不达也。前贤垂训，原欲人辨症而施药，试思寒热往来之为少阳症也，千古不易。既见寒热往来而犹侵柴胡，甘事麻、桂、羌、防，能不偾败乎?且士材所云疟非少阳，宁非指瘅疟、牝疟乎?奈何泥于一而不通乎?概遂致因噎而废食，岂不可叹！因疏倪先生方，而并拈经旨以印之，为同道共商榷焉。且风寒在表之恶寒发热，人虽恶寒而肌肤已热。疟疾之恶寒，内外俱寒，及其发热，绝不恶寒矣。风寒得汗，退热即解。疟疾自能作汗，而退热次日仍复。如是可见其病在里而不在表，非可求汗而解，必里清而表白清。强表徒伤正气，而疟必淹缠。故疟疾有汗者，及其无汗即愈；无汗者，及其有汗即愈。疟之为汗，乃其所自为也，非可强发也。故曰：里气和，汗自出，里和而表从之矣。