| 卷一·礼集 [分卷阅读] | |||
| 草部 | |||
| 卷二·礼集 [分卷阅读] | |||
| 木部 | 果部 | 菜部 | 谷部 |
| 金石部 | 人部 | 兽部 | 禽部 |
| 虫鱼部 | |||
| 卷三·乐集 [分卷阅读] | |||
| 内经要语 | 先哲名言 | 持脉真诀 | 内景详解 |
| 肺 | 大肠 | 胃 | 脾 |
| 心 | 小肠 | 膀胱 | 肾 |
| 心包 | 三焦 | 胆 | 肝 |
| 卷四·乐集 [分卷阅读] | |||
| 摄生 | 阴阳 | 脏象 | 气味 |
| 治则 | 病机 | 运气 | |
| 卷五·乐集 [分卷阅读] | |||
| 论治大纲 | 辨证大纲 | ||
| 卷六·射集 [分卷阅读] | |||
| 伤寒 | 温热 | ||
| 卷七·射集 [分卷阅读] | |||
| 中风 | 燥 | 伤风 | 火 |
| 卷八·御集 [分卷阅读] | |||
| 中暑（中与伤同） | 温 | 疟 | 痢（经谓之肠，后人又名滞下。） |
| 卷九·御集 [分卷阅读] | |||
| 肿胀 | 嗝 | 呕吐 | 霍乱 |
| 干霍乱（俗名绞肠沙。） | 泄泻 | ||
| 卷十·御集 [分卷阅读] | |||
| 伤食 | 不能食 | 气、痞满 | 吞酸嘈杂 |
| 黄胆 | 积聚 | 三消 | |
| 卷十一·书集 [分卷阅读] | |||
| 虚劳 | |||
| 卷十二·书集 [分卷阅读] | |||
| 咳嗽 | 肺痿 | 肺痈 | 痰饮 |
| 喘 | 举例 | 汗 | 不寐 |
| 健忘·怔忡·惊悸 | |||
| 卷十三·书集 [分卷阅读] | |||
| 痿 | 痹 | 麻木 | 厥 |
| 疝（疝字从山，取根深重着之义。） | 痫（病因痫发，故字从痫。） | ||
| 卷十四·数集 [分卷阅读] | |||
| 头痛 | 眩晕 | 目病 | 耳病 |
| 胃脘痛（胸痛、心痛、腹痛。） | 腰痛 | 胁痛 | |
| 卷十五·数集 [分卷阅读] | |||
| 小便不通（交肠、关格二症附后。） | 小便不禁 | 淋 | 举例 |
| 浊 | 遗滑 | 大便秘结 | 大便血 |
| 痉 | 脚气 | ||
| 卷十六·数集 [分卷阅读] | |||
| 调经 | 附《金匮》治妇人杂病五方 | 带下 | 崩漏 |
| 胎胎前 | 产产后 | 〔附仲淳治疔疽一切肿毒神方〔症轻者，制小其剂。〕 | |